恩 ....今天沒幹麻....
繼昨天寫個程式去比對kegg跟smd中有幾個gene是相同,又相同的是哪些
本來想一個一個去比對kegg的圖看有無pathway的路徑關係
不過實在是一件很笨的事情XD
最後我放棄一個一個對,改寫程式去跑

結果如此
紅色的部分就是對應到相同名稱的gene
感想
1.kegg資料庫中有些自訂的term,ex3.4.22-
讓我找不到對應的名稱,而這種東西剛好會夾在兩個找的gene中XD
2.KEGG某些gene可能因為名稱太長會縮短,ex.NFKB1...
可是我在smd中會找到有NFKB1這個gene name,不過不確定是不是相同的
還有的如BCL2,IL1A,IL1R1....,似乎都可以找到對應的XD
3.似乎有做的可行性XD

現在該來看看原smd的paper再說啥啦!!
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