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weka的ci code測試
今天trace程式碼,目前目標是實做看看weka內附的CI-test程式碼
看看對於有無任何幫助
假設有6個基因Gene A~F,假設他們的表現狀態是有(1),跟無(0)
@attribute Gene_A { 0,1 }
@attribute Gene_B { 0,1 }
@attribute Gene_C { 0,1 }
@attribute Gene_D { 0,1 }
@attribute Gene_E { 0,1 }
@attribute Gene_F { 0,1 }
Gene A~F表現的資料如下
@data
0,1,0,0,1,0
1,1,1,1,0,1
1,1,1,0,0,1
0,1,0,0,0,0
0,0,0,1,0,0
1,0,1,1,1,1
weka附的ci 結構建立的結果是
Network structure (nodes followed by parents)
Gene_A(2): Gene_F
Gene_B(2): Gene_F
Gene_C(2): Gene_F
Gene_D(2): Gene_F
Gene_E(2): Gene_F
Gene_F(2):
意思就是說 Gene_F影響其他Genes, A~E
可是我的資料設計是Gene A,C,F表現是一樣的,
所以應該不會有F影響全部情形發生??
跟weka的結果不相同
目前想到以下幾個問題
1.weka的ci測試是大量資料去找結構,跟時間資料不同
2.如何改進正確度
3.是不是資料哪裡設計錯誤??
今天trace程式碼,目前目標是實做看看weka內附的CI-test程式碼
看看對於有無任何幫助
假設有6個基因Gene A~F,假設他們的表現狀態是有(1),跟無(0)
@attribute Gene_A { 0,1 }
@attribute Gene_B { 0,1 }
@attribute Gene_C { 0,1 }
@attribute Gene_D { 0,1 }
@attribute Gene_E { 0,1 }
@attribute Gene_F { 0,1 }
Gene A~F表現的資料如下
@data
0,1,0,0,1,0
1,1,1,1,0,1
1,1,1,0,0,1
0,1,0,0,0,0
0,0,0,1,0,0
1,0,1,1,1,1
weka附的ci 結構建立的結果是
Network structure (nodes followed by parents)
Gene_A(2): Gene_F
Gene_B(2): Gene_F
Gene_C(2): Gene_F
Gene_D(2): Gene_F
Gene_E(2): Gene_F
Gene_F(2):
意思就是說 Gene_F影響其他Genes, A~E
可是我的資料設計是Gene A,C,F表現是一樣的,
所以應該不會有F影響全部情形發生??
跟weka的結果不相同
目前想到以下幾個問題
1.weka的ci測試是大量資料去找結構,跟時間資料不同
2.如何改進正確度
3.是不是資料哪裡設計錯誤??
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